南京中医药大学始建于1954年，是中国建校最早的高等中医药院校之一，是教育部和江苏省共建的国家“世界一流学科建设高校”，是教育部、江苏省人民政府与国家中医药管理局三方共建高校[1]、江苏省重点建设高校、江苏省高水平大学建设高校，是世界一流中医药大学建设联盟、长三角医学教育联盟创始成员，是世界卫生组织（WHO）传统医学合作中心、国家卫生部确定的国际针灸培训中心、全国首批博士和硕士学位授权单位、全国古籍重点保护单位、全国中医师资进修教育基地、国家建设高水平大学公派研究生项目实施高校、国家“特色重点学科项目”建设高校、国家“卓越医生（中医）教育培养计划”改革首批试点高校、国家级人才培养模式创新实验区、中国政府奖学金来华留学生接收院校。
截至2019年9月，学校有33个本科专业；拥有4个一级学科及1个专业学位博士学位授权点，11个一级学科硕士学位及5个专业硕士学位授权点，3个博士后科研流动站；有各类在校生2万余名。截至2020年7月，学校有仙林、汉中门、泰州3个校区。