建立IT审计制度需要注意以下内容：
1、IT审计师是跨信息技术和审计技术的复合型人才，要实施企业的IT审计制度，必须重视和培养合格的IT审计师；
2、企业应该建立相应的IT审计部门或审计岗位，确定部门和岗位职责，并置于企业经营者的直接管理之内；
3、企业应该制定相应的IT审计准则，作为IT审计所进行的依据；
4、遵循国家相关IT审计的法规并结合本企业的业务实际进行。企业的IT审计制度不是一成不变的，它根据具体企业的营运情况可以在每个审计年度终结后、新的审计年度开始前做相应的修改和增删。
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