会计集中核算制度对内部审计工作的影响包括：
1、正面化的影响：即会计集中核算制度有利于提高内部审计的工作效率，减少审计的成本并一定程度上提升了对企业审计活动的管理水平。
2、负面化的影响：即会计集中核算制度不利于审计责任的认定，同时缺乏对相关规章制度的完善，不利于内部审计工作对相关部门经济事项的监督。
其中会计集中核算制度指通过成立会计集中核算机构，在核算单位资金所有权、使用权、财务自主权不变的前提下取消行政事业单位的银行账户，并由会计核算中心统一开设单一账户办理资金结算、会计核算和进行会计监督的制度体系，其实质上是融会计核算、监督、服务于一体的一种特殊的会计核算形式。
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