疫情期间企业发生消杀费用时，可以根据费用所属的部门计入“管理费用”、“销售费用”或“制造费用”等会计科目中。具体会计处理是企业在发生消杀费用并取得对应发票时，可以借记“管理费用”等相关科目，借记“应交税费——应交增值税（进项税额）”科目，然后贷记“银行存款”科目或“库存现金”科目。
其中“管理费用”科目一般用于核算企业为组织和管理企业生产经营所发生的管理支出，“应付职工薪酬”科目用于核算企业根据有关规定应付给职工的各种薪酬。
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