上海交通大学医学院（Shanghai Jiao Tong University School of Medicine）由中华人民共和国教育部、中华人民共和国卫生部和上海市人民政府共建，位列“211工程”、“985工程”，入选教育部第一批卓越医生教育培养计划项目试点高校，是教育部基础医学类教学指导委员会主任委员单位、教育部口腔医学类教学指导委员会副主任委员单位、国家级临床技能实验示范中心学科组长单位、上海市卓越医学教育计划专家组组长单位。
上海交通大学医学院前身是由圣约翰大学医学院（创建于1896年）、震旦大学医学院（创建于1911年）、同德医学院（创建于1918年）于1952年全国高等学校院系调整时合并而成的上海第二医学院；1985年，更名为上海第二医科大学。1997年，学校通过了“211工程”立项。2005年7月18日，上海交通大学与上海第二医科大学合并，成立了由教育部、上海市人民政府重点共建的上海交通大学医学院，进入“985工程”高校行列。2010年11月，学院成为卫生部与教育部合作共建的第一批十个重点高校中的一员。
截至2017年12月31日，学院拥有重庆南路、闵行两个校区；下设25个学院（系），13所附属医院；开办2个八年制专业（授予博士学位）和7个本科专业；4个学科成为国家“双一流”建设学科（其中1个与药学院共建）；有4个一级学科博士后流动站，8个一级学科博士学位授权点；有教职医务员工31926名，专任教师683名，院士35人；在校学生8411名，其中本科及长学制学生2983名，研究生4646名，留学生312名。