关联方交易审计的程序如下：
1、对单位关联方交易的内部控制进行审查评价。
2、查阅单位相关会议的记录并审阅相关的资料。
3、核实单位与其关联方的交易性质。
4、核实单位是否存在未处理的关联方交易。
5、查阅单位报表记录中数额较大且异常或不常发生的金额。
6、审阅单位有关存款借款的询证函是否存在担保关系。
关联方交易审计是审计单位对被审计单位关联方交易的完整性、存在性与合法性所开展的审查监督活动，其目的在于通过解决审计过程中所发现的问题，以提高被审计单位关联方交易信息的透明度。
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