检查原始凭证常用的方法是利用查账人员的经验，对凭证中所列各要素进行审阅，视其是否存在异常之处，发现其中可能存在的错弊，或将原始凭证所反映的经济业务与实际情况进行比较，视其是否存在差异，并分析差异的性质和原因，或者对比分析不同时期同类原始凭证上的相同要素，寻找明显变化，分析其是否具有业务依据和正当原由。对数量繁多的原始凭证，查账人员往往采用抽样检查法，从样本推测总体特性。
除此之外，还可以使用复核法、核对法、推测判断等方法。复核法是对原始凭证所记录反映的有关数据资料进行重复验算。核对法是将记账凭证与所附原始凭证进行核对。推测和判断是对原始凭证所反映的经济业务进行合理假设，并据以判断其结果。
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