分支机构和分公司的主要区别有：
1、性质不同：分公司属于总公司分支机构，在法律上、经济上没有独立性，不具有企业法人资格，仅仅是总公司的附属机构。分公司没有自己的名称、章程，没有自己的财产，并以总公司的资产对分公司的债务承担法律责任；企业分支机构是指由企业法人为实现其职能而在总部之外设立的，可以自己的名义进行民事活动，但是不能独立承担民事责任的非法人组织。
2、会计核算不同：分公司与总公司在经济是统一核算，其实际占有和使用的财产是总公司财产的一部分，列入总公司的资产负债表中；大多数分支机构是一个独立的会计个体，有独立的会计记录和报告系统。它们通常需要设置一套较为完整的账簿，用来记录其本身发生的经济业务，定期编制会计报表，向总部报告。
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